18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0730 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0730  peptidase M15A  100 
 
 		 191 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.0731451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0730  hypothetical protein  92.15 
 
 		 191 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.856878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4487  hypothetical protein  84.57 
 
 		 194 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1484  peptidase M15A  43.24 
 
 		 313 aa  122  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.160791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0930  hypothetical protein  42.57 
 
 		 309 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.581759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1785  hypothetical protein  41.5 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2450  hypothetical protein  35.79 
 
 		 182 aa  48.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00221503  normal  0.212903 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  36.67 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1073  hypothetical protein  35.29 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2154  hypothetical protein  37.21 
 
 		 171 aa  45.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00468929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  40 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2514  twin-arginine translocation pathway signal  34.94 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.465464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2663  protein of unknown function DUF882  29.89 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00451545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  36.26 
 
 		 124 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1572  protein of unknown function DUF882  30.23 
 
 		 189 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1958  hypothetical protein  34.15 
 
 		 182 aa  42  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1829  hypothetical protein  36.14 
 
 		 163 aa  41.2  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  29.52 
 
 		 341 aa  41.2  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>