28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0730 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0730  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.856878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0730  peptidase M15A  92.15 
 
 		 191 aa  350  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.0731451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4487  hypothetical protein  82.63 
 
 		 194 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1484  peptidase M15A  43.92 
 
 		 313 aa  124  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.160791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0930  hypothetical protein  42.57 
 
 		 309 aa  121  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.581759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1785  hypothetical protein  42.18 
 
 		 274 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2450  hypothetical protein  37.89 
 
 		 182 aa  51.6  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00221503  normal  0.212903 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  39.6 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2154  hypothetical protein  38.37 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00468929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2663  protein of unknown function DUF882  31.03 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00451545  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2514  twin-arginine translocation pathway signal  36.14 
 
 		 187 aa  45.1  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.465464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  40 
 
 		 162 aa  44.7  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1441  twin-arginine translocation pathway signal  32.99 
 
 		 183 aa  44.7  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1572  protein of unknown function DUF882  31.4 
 
 		 189 aa  44.7  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1958  hypothetical protein  35.37 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1829  hypothetical protein  37.35 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1899  hypothetical protein  32.04 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1925  hypothetical protein  32.04 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1932  hypothetical protein  32.04 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1073  hypothetical protein  34.12 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2394  protein of unknown function DUF882  32.04 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0868273  normal  0.0323721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1613  hypothetical protein  34.15 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  29.52 
 
 		 341 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3585  hypothetical protein  36.14 
 
 		 186 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1751  twin-arginine translocation pathway signal  29 
 
 		 187 aa  42  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.159115 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1502  hypothetical protein  34.94 
 
 		 182 aa  41.6  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651988  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0380  hypothetical protein  34.15 
 
 		 178 aa  41.2  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2807  hypothetical protein  32.14 
 
 		 229 aa  41.2  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0027608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>