24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1205 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1205  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  266  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4074  hypothetical protein  90.44 
 
 		 137 aa  228  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1643  hypothetical protein  89.71 
 
 		 137 aa  226  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1245  hypothetical protein  93.08 
 
 		 131 aa  222  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000160953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4230  hypothetical protein  60.58 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318595  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2991  membrane protein-like protein  63.97 
 
 		 136 aa  167  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4561  hypothetical protein  57.25 
 
 		 139 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.672359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52000  hypothetical protein  56.52 
 
 		 139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36840  hypothetical protein  62.96 
 
 		 135 aa  137  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.693285  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0898  translation elongation factor Tu  32.43 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000668063 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2248  putative transmembrane protein  44.44 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  32.43 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1898  hypothetical protein  32.95 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  32.54 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0912  membrane protein  30.38 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2990  membrane protein-like  30.84 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  29.2 
 
 		 135 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2778  hypothetical protein  34.91 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  32.04 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1557  hypothetical protein  32.43 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1335  membrane protein-like protein  30.59 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4599  membrane protein  30.28 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  0.568501 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1683  hypothetical protein  32.95 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>