16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4986 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4986  toluene tolerance protein Ttg8  100 
 
 		 201 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4809  hypothetical protein  96.52 
 
 		 224 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4937  toluene tolerance protein  96.52 
 
 		 224 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0530  toluene tolerance protein Ttg8  93.03 
 
 		 201 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66090  hypothetical protein  53.89 
 
 		 216 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5733  hypothetical protein  52.69 
 
 		 216 aa  157  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4985  toluene tolerance protein, putative  46.67 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0480  O-antigen polymerase  44.81 
 
 		 620 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0535  toluene tolerance protein, putative  46.59 
 
 		 251 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0762  toluene tolerance protein, putative  45.29 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.013011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44720  hypothetical protein  45.2 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  28.57 
 
 		 457 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 		 457 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 		 499 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1265  putative LPS biosynthesis enzyme  29.93 
 
 		 277 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  33.01 
 
 		 581 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>