15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4809 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4937  toluene tolerance protein  99.55 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4809  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0530  toluene tolerance protein Ttg8  94.03 
 
 		 201 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4986  toluene tolerance protein Ttg8  96.84 
 
 		 201 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66090  hypothetical protein  55.09 
 
 		 216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5733  hypothetical protein  53.89 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4985  toluene tolerance protein, putative  47.22 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0480  O-antigen polymerase  43.92 
 
 		 620 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0535  toluene tolerance protein, putative  49.09 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0762  toluene tolerance protein, putative  45.29 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.013011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44720  hypothetical protein  45.51 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  27.82 
 
 		 457 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 		 499 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  28.07 
 
 		 457 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1265  putative LPS biosynthesis enzyme  29.8 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>