11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3420 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3420  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  315  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  unclonable  8.3914e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3381  hypothetical protein  81.05 
 
 		 153 aa  261  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2795  hypothetical protein  72.19 
 
 		 153 aa  221  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0799  hypothetical protein  58.52 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.656983  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2186  phage protein  65.32 
 
 		 149 aa  174  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3235  hypothetical protein  58.06 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2433  hypothetical protein  51.49 
 
 		 154 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1000  phage protein  48.55 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5697  hypothetical protein  49.24 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.955716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4855  hypothetical protein  54.64 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66713  normal  0.0219213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1284  hypothetical protein  44.21 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714449  normal  0.0910704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>