11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2795 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2795  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  315  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3381  hypothetical protein  72.85 
 
 
153 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3420  hypothetical protein  72.19 
 
 
153 aa  221  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  unclonable  8.3914e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0799  hypothetical protein  57.58 
 
 
157 aa  174  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.656983  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2186  phage protein  56.15 
 
 
149 aa  157  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3235  hypothetical protein  57.69 
 
 
154 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2433  hypothetical protein  57.38 
 
 
154 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1000  phage protein  45.65 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5697  hypothetical protein  48 
 
 
152 aa  110  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.955716  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4855  hypothetical protein  57.78 
 
 
97 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66713  normal  0.0219213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1284  hypothetical protein  45.54 
 
 
136 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714449  normal  0.0910704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>