12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1000 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1000  phage protein  100 
 
 		 157 aa  320  5e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022845 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0799  hypothetical protein  56.72 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.656983  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2186  phage protein  53.59 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3235  hypothetical protein  52.63 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164083 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3381  hypothetical protein  51.45 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3420  hypothetical protein  48.55 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  unclonable  8.3914e-17 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2795  hypothetical protein  45.65 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2433  hypothetical protein  41.77 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5697  hypothetical protein  44.27 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.955716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4855  hypothetical protein  45.36 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66713  normal  0.0219213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1284  hypothetical protein  38.61 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714449  normal  0.0910704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0632  gp1  67.86 
 
 		 85 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>