17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0342 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0342  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0319  hypothetical protein  98.99 
 
 		 100 aa  197  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0341  hypothetical protein  98.99 
 
 		 100 aa  197  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4888  hypothetical protein  93.94 
 
 		 100 aa  185  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.369158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0469  hypothetical protein  55 
 
 		 100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4704  hypothetical protein  55.1 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0449  hypothetical protein  63.33 
 
 		 100 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.4241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6195  hypothetical protein  37.08 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18240  hypothetical protein  35.79 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71370  hypothetical protein  37.21 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  33.73 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1130  hypothetical protein  32.58 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  30.21 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  28.24 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  28.95 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2054  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  40.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911462  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1182  hypothetical protein  28.41 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>