20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_18240 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_18240  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  181  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649649  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6195  hypothetical protein  46.74 
 
 
96 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71370  hypothetical protein  45.65 
 
 
96 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0469  hypothetical protein  34.78 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4704  hypothetical protein  33.7 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764072  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0341  hypothetical protein  35.79 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0319  hypothetical protein  35.79 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0449  hypothetical protein  38.46 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.4241  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0342  hypothetical protein  35.79 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4888  hypothetical protein  37.5 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.369158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1128  hypothetical protein  30.12 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.13386  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1694  hypothetical protein  32.5 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00667854  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2038  hypothetical protein  35.94 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.251237  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0127  hypothetical protein  35.94 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106139  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  28.75 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2540  putative cell division protein ZapA  36.36 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  31.17 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1130  hypothetical protein  30.86 
 
 
99 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0979  hypothetical protein  32.14 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.35224  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3370  hypothetical protein  32.91 
 
 
88 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>