18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0449 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0449  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  203  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.4241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0469  hypothetical protein  71 
 
 		 100 aa  147  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4704  hypothetical protein  70.1 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4888  hypothetical protein  66.67 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.369158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0342  hypothetical protein  63.33 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0341  hypothetical protein  63.33 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0319  hypothetical protein  63.33 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6195  hypothetical protein  45.56 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71370  hypothetical protein  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18240  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649649  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  31.87 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  30.59 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2054  hypothetical protein  31.91 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911462  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  28.26 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0077  hypothetical protein  32.97 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0089  hypothetical protein  32.97 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03552  hypothetical protein  29.79 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0829  hypothetical protein  29.87 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>