21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4888 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4888  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.369158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0342  hypothetical protein  93.94 
 
 		 100 aa  185  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0319  hypothetical protein  93 
 
 		 100 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0341  hypothetical protein  93 
 
 		 100 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0469  hypothetical protein  58.59 
 
 		 100 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4704  hypothetical protein  58.16 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0449  hypothetical protein  66.67 
 
 		 100 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.4241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6195  hypothetical protein  38.2 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18240  hypothetical protein  37.5 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71370  hypothetical protein  38.37 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  34.94 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1130  hypothetical protein  34.09 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  32.29 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  28.09 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2788  hypothetical protein  38.18 
 
 		 133 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.899312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  27.96 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3280  protein of unknown function DUF710  29.9 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0411428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1825  protein of unknown function DUF710  26.32 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12217  hitchhiker  0.000000212758 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  30.26 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1182  hypothetical protein  28.41 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  27.59 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>