19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_71370 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_71370  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6195  hypothetical protein  97.89 
 
 
96 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18240  hypothetical protein  45.65 
 
 
93 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649649  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4704  hypothetical protein  43.18 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764072  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0469  hypothetical protein  42.7 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0449  hypothetical protein  45.45 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.4241  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0342  hypothetical protein  37.21 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4888  hypothetical protein  38.37 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.369158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0341  hypothetical protein  35.16 
 
 
100 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0319  hypothetical protein  35.16 
 
 
100 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  31.82 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0077  hypothetical protein  31.82 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0089  hypothetical protein  31.82 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2540  putative cell division protein ZapA  30.95 
 
 
113 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  33.87 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  33.87 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2038  hypothetical protein  25.88 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.251237  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0127  hypothetical protein  25.88 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106139  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  26.53 
 
 
106 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>