17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2018 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2018  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  197  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1604  hypothetical protein  82.14 
 
 
96 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000274269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2650  hypothetical protein  80.95 
 
 
97 aa  147  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00012678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1566  hypothetical protein  79.76 
 
 
97 aa  146  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2014  hypothetical protein  79.76 
 
 
96 aa  145  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1830  hypothetical protein  77.38 
 
 
97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000442352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0989  hypothetical protein  77.38 
 
 
98 aa  144  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000432022  decreased coverage  0.0038669 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1309  hypothetical protein  64.29 
 
 
94 aa  123  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.82918e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0116  hypothetical protein  49.45 
 
 
94 aa  95.1  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000783686  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2833  hypothetical protein  49.45 
 
 
91 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000637207  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2048  hypothetical protein  56.25 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1334  hypothetical protein  46.24 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.672757  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1932  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.700182  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0549  hypothetical protein  45.45 
 
 
91 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1811  hypothetical protein  54.69 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697321  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1864  hypothetical protein  42.31 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.215821  normal  0.0538289 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2947  hypothetical protein  42.86 
 
 
72 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.926437  normal  0.569731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>