17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0549 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0549  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  189  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122857 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1334  hypothetical protein  74.73 
 
 		 90 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.672757  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1932  hypothetical protein  70.24 
 
 		 87 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.700182  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1811  hypothetical protein  66.67 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697321  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1864  hypothetical protein  52.69 
 
 		 93 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.215821  normal  0.0538289 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2048  hypothetical protein  57.65 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0116  hypothetical protein  50.65 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000783686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2833  hypothetical protein  47.37 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000637207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2650  hypothetical protein  48.15 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00012678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1566  hypothetical protein  48.75 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213477  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1309  hypothetical protein  47.83 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.82918e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0989  hypothetical protein  46.27 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000432022  decreased coverage  0.0038669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2014  hypothetical protein  43.28 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1830  hypothetical protein  46.27 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000442352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1604  hypothetical protein  45.45 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000274269  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2018  hypothetical protein  43.04 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655159  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2947  hypothetical protein  42 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.926437  normal  0.569731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>