17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2014 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2014  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0989  hypothetical protein  85.71 
 
 		 98 aa  152  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000432022  decreased coverage  0.0038669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1830  hypothetical protein  82.14 
 
 		 97 aa  149  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000442352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2650  hypothetical protein  79.76 
 
 		 97 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00012678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1566  hypothetical protein  78.57 
 
 		 97 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2018  hypothetical protein  79.76 
 
 		 97 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1604  hypothetical protein  78.57 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000274269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1309  hypothetical protein  69.05 
 
 		 94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.82918e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0116  hypothetical protein  48.94 
 
 		 94 aa  98.2  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000783686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2833  hypothetical protein  51.65 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000637207  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1932  hypothetical protein  53.25 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.700182  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1334  hypothetical protein  46.81 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.672757  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0549  hypothetical protein  45.45 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122857 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1864  hypothetical protein  46.84 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.215821  normal  0.0538289 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2048  hypothetical protein  48.05 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1811  hypothetical protein  47.37 
 
 		 89 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2947  hypothetical protein  41.18 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.926437  normal  0.569731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>