17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0989 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0989  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  197  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000432022  decreased coverage  0.0038669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1830  hypothetical protein  88.1 
 
 
97 aa  158  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000442352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2014  hypothetical protein  85.71 
 
 
96 aa  152  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1566  hypothetical protein  82.14 
 
 
97 aa  149  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2650  hypothetical protein  80.95 
 
 
97 aa  147  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00012678 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1604  hypothetical protein  80.95 
 
 
96 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000274269  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2018  hypothetical protein  77.38 
 
 
97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1309  hypothetical protein  69.05 
 
 
94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.82918e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0116  hypothetical protein  50.55 
 
 
94 aa  97.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000783686  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2833  hypothetical protein  50.55 
 
 
91 aa  88.2  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000637207  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1932  hypothetical protein  53.95 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.700182  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1334  hypothetical protein  47.31 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.672757  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0549  hypothetical protein  48.68 
 
 
91 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122857 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2048  hypothetical protein  47.37 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1864  hypothetical protein  44.87 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.215821  normal  0.0538289 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1811  hypothetical protein  52.63 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2947  hypothetical protein  36.76 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.926437  normal  0.569731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>