17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1566 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1566  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2650  hypothetical protein  98.97 
 
 		 97 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00012678 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1830  hypothetical protein  84.52 
 
 		 97 aa  155  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000442352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0989  hypothetical protein  82.14 
 
 		 98 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000432022  decreased coverage  0.0038669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2018  hypothetical protein  79.76 
 
 		 97 aa  147  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655159  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2014  hypothetical protein  78.57 
 
 		 96 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1604  hypothetical protein  77.38 
 
 		 96 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000274269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1309  hypothetical protein  63.1 
 
 		 94 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.82918e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0116  hypothetical protein  52.22 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000783686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2833  hypothetical protein  49.45 
 
 		 91 aa  88.2  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000637207  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1334  hypothetical protein  49.45 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.672757  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0549  hypothetical protein  51.72 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122857 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1932  hypothetical protein  52.7 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.700182  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1864  hypothetical protein  46.84 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.215821  normal  0.0538289 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1811  hypothetical protein  60.32 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697321  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2048  hypothetical protein  54.84 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2947  hypothetical protein  38.1 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.926437  normal  0.569731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>