14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2837 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2837  protein of unknown function DUF452  100 
 
 
229 aa  474  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2428  protein of unknown function DUF452  55.46 
 
 
227 aa  252  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2068  hypothetical protein  52.65 
 
 
227 aa  234  6e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0080  hypothetical protein  46.64 
 
 
257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0114  hypothetical protein  50.22 
 
 
228 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2456  protein of unknown function DUF452  44.74 
 
 
229 aa  218  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2188  protein of unknown function DUF452  44.05 
 
 
228 aa  206  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1618  hypothetical protein  33.48 
 
 
228 aa  107  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2920  hypothetical protein  31.88 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0786757  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1386  conserved hypothetical protein (DUF452 domain protein)  27.63 
 
 
204 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0085  hypothetical protein  25.86 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0350  hypothetical protein  25 
 
 
203 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0327  hypothetical protein  24.56 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1660  hypothetical protein  25.67 
 
 
203 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>