13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1386 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1386  conserved hypothetical protein (DUF452 domain protein)  100 
 
 		 204 aa  397  9.999999999999999e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0327  hypothetical protein  56.65 
 
 		 203 aa  207  9e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0350  hypothetical protein  56.65 
 
 		 203 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1660  hypothetical protein  50.74 
 
 		 203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0085  hypothetical protein  39.2 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1618  hypothetical protein  27.43 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2920  hypothetical protein  24.76 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0786757  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2837  protein of unknown function DUF452  27.63 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2068  hypothetical protein  29.55 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2456  protein of unknown function DUF452  29.3 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0114  hypothetical protein  25.11 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2428  protein of unknown function DUF452  23.42 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2188  protein of unknown function DUF452  24.56 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>