14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2428 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2428  protein of unknown function DUF452  100 
 
 		 227 aa  472  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2837  protein of unknown function DUF452  55.46 
 
 		 229 aa  252  3e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0114  hypothetical protein  52.63 
 
 		 228 aa  228  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2456  protein of unknown function DUF452  42.04 
 
 		 229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2068  hypothetical protein  47.3 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2188  protein of unknown function DUF452  43.61 
 
 		 228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0080  hypothetical protein  38.52 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1618  hypothetical protein  35.27 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2920  hypothetical protein  28.57 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0786757  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0085  hypothetical protein  26.64 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0327  hypothetical protein  22.57 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1660  hypothetical protein  20.98 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0350  hypothetical protein  22.12 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1386  conserved hypothetical protein (DUF452 domain protein)  23.42 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>