13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2920 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2920  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  400  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0786757  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2837  protein of unknown function DUF452  31.88 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1386  conserved hypothetical protein (DUF452 domain protein)  24.76 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0114  hypothetical protein  28.63 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1660  hypothetical protein  25.6 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2428  protein of unknown function DUF452  28.57 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1618  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2188  protein of unknown function DUF452  30.04 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0327  hypothetical protein  24.64 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0350  hypothetical protein  24.64 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2068  hypothetical protein  30.7 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2456  protein of unknown function DUF452  28 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0080  hypothetical protein  34.85 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>