13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2327 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2327  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  277  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0949248  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1962  hypothetical protein  54.74 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0346722  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1841  hypothetical protein  50.74 
 
 		 138 aa  147  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.937194  normal  0.116034 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0037  hypothetical protein  50.38 
 
 		 138 aa  140  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127465  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0122  hypothetical protein  48.53 
 
 		 142 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0030  hypothetical protein  45.24 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000157764  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2119  hypothetical protein  39.84 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0928367  normal  0.329067 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2265  hypothetical protein  35.56 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.183591  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1765  hypothetical protein  34.31 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0176  hypothetical protein  30.53 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44991  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0812  hypothetical protein  31.16 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0058  hypothetical protein  34.56 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0411  hypothetical protein  30.43 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.376676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>