13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1841 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1841  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  280  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.937194  normal  0.116034 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2327  hypothetical protein  50.74 
 
 
137 aa  147  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0949248  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0122  hypothetical protein  48.2 
 
 
142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0037  hypothetical protein  46.97 
 
 
138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127465  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1962  hypothetical protein  43.48 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0346722  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0030  hypothetical protein  37.98 
 
 
142 aa  98.2  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000157764  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0058  hypothetical protein  36.5 
 
 
139 aa  97.4  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1765  hypothetical protein  32.12 
 
 
139 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2265  hypothetical protein  29.2 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.183591  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2119  hypothetical protein  31.3 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0928367  normal  0.329067 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0411  hypothetical protein  31.06 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.376676 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0812  hypothetical protein  28.68 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0176  hypothetical protein  27.48 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>