13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0812 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0812  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  290  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0411  hypothetical protein  47.37 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.376676 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1765  hypothetical protein  45.26 
 
 
139 aa  130  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2119  hypothetical protein  46.15 
 
 
140 aa  120  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0928367  normal  0.329067 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2265  hypothetical protein  41.61 
 
 
139 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.183591  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0176  hypothetical protein  40.3 
 
 
140 aa  103  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44991  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2327  hypothetical protein  31.16 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0949248  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1841  hypothetical protein  28.68 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.937194  normal  0.116034 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1962  hypothetical protein  33.08 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0346722  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0122  hypothetical protein  29.37 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0037  hypothetical protein  24.43 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127465  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0030  hypothetical protein  26.95 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000157764  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0058  hypothetical protein  25.55 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>