13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2119 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2119  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  279  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0928367  normal  0.329067 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1765  hypothetical protein  56.62 
 
 
139 aa  163  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2265  hypothetical protein  56.59 
 
 
139 aa  152  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.183591  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0411  hypothetical protein  52.67 
 
 
138 aa  148  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.376676 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0812  hypothetical protein  46.15 
 
 
143 aa  120  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0176  hypothetical protein  37.9 
 
 
140 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44991  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1962  hypothetical protein  41.41 
 
 
137 aa  100  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0346722  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2327  hypothetical protein  39.84 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0949248  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0037  hypothetical protein  34.85 
 
 
138 aa  88.2  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127465  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0122  hypothetical protein  30.22 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1841  hypothetical protein  31.3 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.937194  normal  0.116034 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0030  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000157764  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0058  hypothetical protein  30.33 
 
 
139 aa  59.3  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>