13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0058 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0058  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  273  8e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0122  hypothetical protein  40.74 
 
 
142 aa  98.6  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1841  hypothetical protein  36.5 
 
 
138 aa  97.4  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.937194  normal  0.116034 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0030  hypothetical protein  35.66 
 
 
142 aa  83.6  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000157764  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2327  hypothetical protein  34.56 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0949248  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1962  hypothetical protein  32.59 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0346722  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0037  hypothetical protein  33.83 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127465  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2265  hypothetical protein  34.59 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.183591  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1765  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2119  hypothetical protein  30.33 
 
 
140 aa  59.3  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0928367  normal  0.329067 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0176  hypothetical protein  28.69 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44991  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0411  hypothetical protein  26.83 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.376676 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0812  hypothetical protein  25.55 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>