23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2006 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2006  conserved hypothetical protein, membrane  100 
 
 		 228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5124  hypothetical protein  33.06 
 
 		 247 aa  101  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4167  hypothetical protein  33.18 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2288  hypothetical protein  28.92 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2211  hypothetical protein  36.36 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.33866  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1009  hypothetical protein  31.58 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1644  hypothetical protein  33.91 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1081  hypothetical protein  30.66 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0206788  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1767  hypothetical protein  29.41 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0819804  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09828  hypothetical protein  30.7 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1851  hypothetical protein  29.46 
 
 		 272 aa  72  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.976117  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2282  hypothetical protein  29.34 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3043  hypothetical protein  30.83 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01800  hypothetical protein  29.39 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0199876  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2660  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0372  conserved hypothetical protein, membrane  34.95 
 
 		 127 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0252547 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15480  hypothetical protein  29.78 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.210824  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0980  hypothetical protein  25.51 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2524  hypothetical protein  35.64 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00176428  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1331  hypothetical protein  43.1 
 
 		 131 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389161  normal  0.611405 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1704  hypothetical protein  42.62 
 
 		 130 aa  42.4  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3170  hypothetical protein  32.63 
 
 		 183 aa  42  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1402  hypothetical protein  40.68 
 
 		 158 aa  42  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.494942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>