26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4167 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4167  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2211  hypothetical protein  30.08 
 
 
238 aa  105  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.33866  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1767  hypothetical protein  31.03 
 
 
239 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0819804  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2006  conserved hypothetical protein, membrane  33.19 
 
 
228 aa  92.4  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3043  hypothetical protein  31.75 
 
 
257 aa  92  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01800  hypothetical protein  25.38 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0199876  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5124  hypothetical protein  31.4 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1644  hypothetical protein  31.51 
 
 
247 aa  85.5  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09828  hypothetical protein  31.09 
 
 
238 aa  85.5  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1081  hypothetical protein  29.57 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0206788  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2288  hypothetical protein  27.38 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1851  hypothetical protein  28.68 
 
 
272 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.976117  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1009  hypothetical protein  30.49 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2524  hypothetical protein  30.04 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00176428  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0980  hypothetical protein  25.58 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2282  hypothetical protein  27.24 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15480  hypothetical protein  26.94 
 
 
249 aa  56.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.210824  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2660  hypothetical protein  44.83 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18100  hypothetical protein  37.18 
 
 
123 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.358293  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1331  hypothetical protein  35.29 
 
 
131 aa  46.2  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389161  normal  0.611405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3170  hypothetical protein  36.05 
 
 
183 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1402  hypothetical protein  36.62 
 
 
158 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.494942  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2416  hypothetical protein  33.67 
 
 
190 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2030  hypothetical protein  33.77 
 
 
129 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0474399 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1216  hypothetical protein  24.32 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.697857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0372  conserved hypothetical protein, membrane  35.29 
 
 
127 aa  42.4  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0252547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>