30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1009 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1009  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  485  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2282  hypothetical protein  36.33 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15480  hypothetical protein  31.78 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.210824  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0980  hypothetical protein  28.57 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09828  hypothetical protein  28.46 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2211  hypothetical protein  28.11 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.33866  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2006  conserved hypothetical protein, membrane  32.05 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1081  hypothetical protein  30.3 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0206788  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01800  hypothetical protein  30.5 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0199876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3043  hypothetical protein  31.1 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4167  hypothetical protein  30.87 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1851  hypothetical protein  31.78 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.976117  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1767  hypothetical protein  29.46 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0819804  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1644  hypothetical protein  30.42 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2416  hypothetical protein  39.81 
 
 
190 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2660  hypothetical protein  43.84 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1414  hypothetical protein  41.3 
 
 
167 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000617244 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5124  hypothetical protein  25.88 
 
 
247 aa  55.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1402  hypothetical protein  45.21 
 
 
158 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.494942  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0372  conserved hypothetical protein, membrane  40.85 
 
 
127 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0252547 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1837  hypothetical protein  48.81 
 
 
144 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.254917  normal  0.448717 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1704  hypothetical protein  50.7 
 
 
130 aa  50.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1331  hypothetical protein  35.14 
 
 
131 aa  49.3  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389161  normal  0.611405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2288  hypothetical protein  24.81 
 
 
277 aa  49.3  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2524  hypothetical protein  29.25 
 
 
228 aa  49.3  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00176428  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11210  hypothetical protein  35 
 
 
254 aa  48.5  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18100  hypothetical protein  35.51 
 
 
123 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.358293  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2092  hypothetical protein  42.86 
 
 
192 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.028414  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0333  hypothetical protein  28.18 
 
 
209 aa  45.4  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2502  hypothetical protein  30 
 
 
148 aa  42  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0352643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>