20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1925 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1925  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  216  8.999999999999998e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.577323  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2675  hypothetical protein  43.01 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0677019  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2752  hypothetical protein  45.88 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2875  hypothetical protein  39.08 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000535369 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2184  hypothetical protein  45.68 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0946  hypothetical protein  37.38 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1261  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000635316 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0290  hypothetical protein  38.27 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2515  hypothetical protein  37.04 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.752602  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3293  hypothetical protein  37.65 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.511705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0563  hypothetical protein  39.56 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0688  hypothetical protein  34.12 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2011  CopG/DNA-binding domain-containing protein  34.94 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226178  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2182  hypothetical protein  34.44 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0140111  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0548  hypothetical protein  36.17 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2199  hypothetical protein  34.44 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1787  hypothetical protein  37.35 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0521  hypothetical protein  31.82 
 
 		 94 aa  50.1  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1840  hypothetical protein  33.73 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1800  hypothetical protein  33.73 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>