15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0548 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0548  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  193  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2184  hypothetical protein  40.7 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1925  hypothetical protein  36.17 
 
 
106 aa  52.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.577323  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3293  hypothetical protein  38.37 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.511705  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1261  hypothetical protein  37.5 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000635316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0563  hypothetical protein  34.18 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2675  hypothetical protein  35.96 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0677019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2011  CopG/DNA-binding domain-containing protein  34.12 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226178  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0521  hypothetical protein  34.78 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2875  hypothetical protein  31.65 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000535369 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0946  hypothetical protein  32.91 
 
 
112 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0688  hypothetical protein  35.71 
 
 
90 aa  47.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2752  hypothetical protein  34.02 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2515  hypothetical protein  28.41 
 
 
99 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.752602  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0290  hypothetical protein  29.17 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>