20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2875 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2875  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  226  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000535369 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0563  hypothetical protein  82.14 
 
 
112 aa  193  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0946  hypothetical protein  77.68 
 
 
112 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0290  hypothetical protein  45.36 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2515  hypothetical protein  49.4 
 
 
99 aa  90.1  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.752602  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2752  hypothetical protein  45.35 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2675  hypothetical protein  46.94 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0677019  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2184  hypothetical protein  48.72 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2199  hypothetical protein  47.62 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2182  hypothetical protein  49.32 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0140111  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0688  hypothetical protein  47.56 
 
 
90 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2011  CopG/DNA-binding domain-containing protein  39.18 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226178  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1261  hypothetical protein  44.19 
 
 
100 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000635316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3293  hypothetical protein  44.3 
 
 
90 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.511705  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0521  hypothetical protein  42.68 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1925  hypothetical protein  39.08 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.577323  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1787  hypothetical protein  33.71 
 
 
85 aa  67  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1800  hypothetical protein  35.96 
 
 
85 aa  65.1  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1840  hypothetical protein  35.96 
 
 
85 aa  65.1  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0548  hypothetical protein  31.65 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>