19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1800 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1800  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  170  6.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1840  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  170  6.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1787  hypothetical protein  82.14 
 
 
85 aa  149  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2752  hypothetical protein  40 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2875  hypothetical protein  35.96 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000535369 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2184  hypothetical protein  32.5 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0563  hypothetical protein  35.8 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0946  hypothetical protein  35.37 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0290  hypothetical protein  32.93 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2515  hypothetical protein  31.71 
 
 
99 aa  61.6  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.752602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2011  CopG/DNA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226178  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3293  hypothetical protein  35.8 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.511705  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2675  hypothetical protein  36.71 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0677019  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0521  hypothetical protein  32.93 
 
 
94 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1925  hypothetical protein  33.73 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.577323  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0688  hypothetical protein  30.86 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2182  hypothetical protein  32.91 
 
 
98 aa  48.9  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0140111  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1261  hypothetical protein  35.19 
 
 
100 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000635316 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2199  hypothetical protein  32.91 
 
 
98 aa  47.8  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>