12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1400 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1400  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  165  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0419253  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1286  hypothetical protein  81.71 
 
 		 81 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.80625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0239  hypothetical protein  69.23 
 
 		 79 aa  92.8  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0181  hypothetical protein  64.18 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1609  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1612  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0086  hypothetical protein  54.9 
 
 		 73 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0363306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2943  hypothetical protein  45.45 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000600828  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1567  hypothetical protein  43.86 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0160768  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19580  hypothetical protein  44.78 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1654  hypothetical protein  40.68 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0550  hypothetical protein  43.64 
 
 		 66 aa  40  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.104766  hitchhiker  0.0000860176 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>