12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2943 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2943  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  164  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000600828  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19580  hypothetical protein  68.57 
 
 
69 aa  100  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1567  hypothetical protein  70.15 
 
 
100 aa  94  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0160768  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0550  hypothetical protein  65.15 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.104766  hitchhiker  0.0000860176 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1654  hypothetical protein  56.06 
 
 
66 aa  76.3  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1609  hypothetical protein  50.7 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0239  hypothetical protein  58.33 
 
 
79 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1612  hypothetical protein  47.89 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0181  hypothetical protein  55 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0086  hypothetical protein  42.47 
 
 
73 aa  53.5  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0363306  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1286  hypothetical protein  40 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.80625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1400  hypothetical protein  48.28 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0419253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>