10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0550 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0550  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  129  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.104766  hitchhiker  0.0000860176 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2943  hypothetical protein  65.15 
 
 		 83 aa  86.3  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000600828  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1654  hypothetical protein  60.61 
 
 		 66 aa  84  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1567  hypothetical protein  60.61 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0160768  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19580  hypothetical protein  56.06 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1609  hypothetical protein  50.75 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1612  hypothetical protein  49.25 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0086  hypothetical protein  47.06 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0363306  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0239  hypothetical protein  47.37 
 
 		 79 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0181  hypothetical protein  43.86 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>