12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0239 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0239  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  159  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0181  hypothetical protein  79.75 
 
 
79 aa  134  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1609  hypothetical protein  62.12 
 
 
67 aa  90.1  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1612  hypothetical protein  67.74 
 
 
67 aa  90.1  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1400  hypothetical protein  74.14 
 
 
83 aa  88.2  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0419253  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1286  hypothetical protein  59.09 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.80625  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0086  hypothetical protein  48.48 
 
 
73 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0363306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2943  hypothetical protein  58.33 
 
 
83 aa  62  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000600828  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1567  hypothetical protein  47.69 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0160768  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19580  hypothetical protein  52.38 
 
 
69 aa  54.3  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0550  hypothetical protein  47.37 
 
 
66 aa  48.9  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.104766  hitchhiker  0.0000860176 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1654  hypothetical protein  44.83 
 
 
66 aa  47  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>