12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1567 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1567  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  201  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0160768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2943  hypothetical protein  70.15 
 
 
83 aa  93.6  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000600828  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19580  hypothetical protein  62.12 
 
 
69 aa  88.6  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0550  hypothetical protein  60.61 
 
 
66 aa  79.7  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.104766  hitchhiker  0.0000860176 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1654  hypothetical protein  56.9 
 
 
66 aa  70.9  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0239  hypothetical protein  51.72 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1609  hypothetical protein  45.45 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1612  hypothetical protein  45.45 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0181  hypothetical protein  46.77 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0086  hypothetical protein  48.33 
 
 
73 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0363306  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1286  hypothetical protein  43.1 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.80625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1400  hypothetical protein  43.86 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0419253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>