31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0612 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0612  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0702  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  45.41 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0678  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  45.41 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0389  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  42.92 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1573  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  44.35 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0159916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.9 
 
 		 344 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0836  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, C subunit  26.05 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19230  Electron transport complex, subunit G  27.51 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2019  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  22.17 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0630  FMN-binding domain-containing protein  32.09 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.033917  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1159  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.99 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1958  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.15 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.537285  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1032  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.16 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0213  FMN-binding domain-containing protein  36.64 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000585453  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1868  electron transport complex protein RnfG  26.11 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803831  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  25.55 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0686  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  24.79 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.63 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1171  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  23.89 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1489  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.81 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0063  FMN-binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  21.89 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2630  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  23.73 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3196  RnfA-Nqr electron transport subunit  25.66 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.401599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1382  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.53 
 
 		 190 aa  42.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000652446  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1157  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.2 
 
 		 181 aa  42.7  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1783  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.69 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  29.93 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2993  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.06 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002945  electron transport complex protein RnfG  27.51 
 
 		 210 aa  42.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0651  FMN-binding domain-containing protein  29.13 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.330764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>