27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0702 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0702  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0678  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0389  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  47.14 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0612  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  45.41 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1573  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  48.42 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0159916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.7 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.11 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02733  electron transport complex protein RnfG  26.64 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0287  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.97 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0817829  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.79 
 
 		 185 aa  45.4  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2969  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.97 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2697  FMN-binding domain-containing protein  27.41 
 
 		 304 aa  45.1  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  0.011631 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  25.93 
 
 		 201 aa  45.4  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1032  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.25 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480333  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02968  electron transport complex protein RnfG  28.18 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19230  Electron transport complex, subunit G  26.79 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  24.77 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1400  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.64 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1171  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.68 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2630  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.2 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18900  hypothetical protein  26.82 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0705821  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2019  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  24.24 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1063  electron transport complex protein RnfG  28.91 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137113  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.64 
 
 		 178 aa  42  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1159  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.27 
 
 		 222 aa  41.6  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0934  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.11 
 
 		 233 aa  41.6  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0306  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.25 
 
 		 215 aa  41.6  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>