22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0389 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0389  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  100 
 
 		 229 aa  457  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1573  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  53.46 
 
 		 225 aa  202  4e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0159916  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0702  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  47.14 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0678  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  47.14 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0612  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  42.92 
 
 		 232 aa  168  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1032  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.15 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480333  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  26.79 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0213  FMN-binding domain-containing protein  29.49 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000585453  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0306  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.52 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.78 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3196  RnfA-Nqr electron transport subunit  26.03 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.401599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.79 
 
 		 344 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1834  electron transport complex protein RnfG  27.56 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.856968  normal  0.105681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2404  electron transport complex protein RnfG  26.22 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.59015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2630  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.97 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1159  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.39 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2195  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  23.83 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648995  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1400  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  24.26 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.45 
 
 		 368 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0812  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  22.79 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151893  normal  0.42525 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.77 
 
 		 197 aa  42.4  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3196  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>