14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2254 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2254  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  816    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00552283  normal  0.124738 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3369  hypothetical protein  63.32 
 
 		 389 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2416  hypothetical protein  62.11 
 
 		 396 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.413423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1676  hypothetical protein  45.48 
 
 		 399 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2071  hypothetical protein  42.93 
 
 		 403 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129176  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2021  hypothetical protein  42.93 
 
 		 414 aa  316  4e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.554669  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0454  hypothetical protein  43.25 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0985  hypothetical protein  41.13 
 
 		 415 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.257353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1146  hypothetical protein  41.13 
 
 		 415 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00151555  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2125  hypothetical protein  40.63 
 
 		 440 aa  260  3e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1209  hypothetical protein  39.28 
 
 		 402 aa  256  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000156557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3064  hypothetical protein  40.05 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1567  hypothetical protein  40.73 
 
 		 447 aa  252  9.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1611  hypothetical protein  43.71 
 
 		 382 aa  238  9e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>