14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2416 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2416  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  819    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.413423  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2254  hypothetical protein  62.11 
 
 
390 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00552283  normal  0.124738 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3369  hypothetical protein  59.38 
 
 
389 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2021  hypothetical protein  41.18 
 
 
414 aa  311  1e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.554669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1676  hypothetical protein  40.62 
 
 
399 aa  289  6e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2071  hypothetical protein  37.5 
 
 
403 aa  269  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129176  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0454  hypothetical protein  37.91 
 
 
421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2125  hypothetical protein  39.32 
 
 
440 aa  246  4e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3064  hypothetical protein  38.98 
 
 
402 aa  236  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1209  hypothetical protein  38.71 
 
 
402 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000156557  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0985  hypothetical protein  35.54 
 
 
415 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.257353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1146  hypothetical protein  34.99 
 
 
415 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00151555  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1567  hypothetical protein  37.54 
 
 
447 aa  223  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1611  hypothetical protein  35.19 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>