14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1209 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1209  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  837    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000156557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3064  hypothetical protein  96.52 
 
 		 402 aa  790    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1676  hypothetical protein  52.01 
 
 		 399 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2071  hypothetical protein  50 
 
 		 403 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129176  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0454  hypothetical protein  50.74 
 
 		 421 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2125  hypothetical protein  50.37 
 
 		 440 aa  393  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1146  hypothetical protein  46.4 
 
 		 415 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00151555  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0985  hypothetical protein  46.15 
 
 		 415 aa  358  7e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.257353  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1567  hypothetical protein  45.68 
 
 		 447 aa  347  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3369  hypothetical protein  47.73 
 
 		 389 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2021  hypothetical protein  45.45 
 
 		 414 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.554669  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1611  hypothetical protein  47.55 
 
 		 382 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2254  hypothetical protein  39.28 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00552283  normal  0.124738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2416  hypothetical protein  38.71 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.413423  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>