14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3369 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3369  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  804    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2254  hypothetical protein  63.32 
 
 
390 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00552283  normal  0.124738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2416  hypothetical protein  59.38 
 
 
396 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.413423  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2021  hypothetical protein  47.83 
 
 
414 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.554669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1676  hypothetical protein  47.11 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2071  hypothetical protein  45.17 
 
 
403 aa  336  5e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3064  hypothetical protein  48.23 
 
 
402 aa  332  8e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1209  hypothetical protein  47.73 
 
 
402 aa  328  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000156557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0454  hypothetical protein  46.87 
 
 
421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1146  hypothetical protein  40.69 
 
 
415 aa  280  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00151555  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2125  hypothetical protein  43.66 
 
 
440 aa  276  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0985  hypothetical protein  41.25 
 
 
415 aa  276  6e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.257353  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1567  hypothetical protein  41.53 
 
 
447 aa  271  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1611  hypothetical protein  39.13 
 
 
382 aa  243  5e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>