19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1886 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1886  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 197 aa  387  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.677546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2185  phosphoglycerate mutase  55.14 
 
 		 188 aa  209  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3911  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  49.71 
 
 		 187 aa  154  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1928  fructose-2,6-bisphosphatase  45.39 
 
 		 199 aa  127  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3155  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  43.01 
 
 		 180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.254789  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1627  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.1 
 
 		 193 aa  111  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0905  Phosphoglycerate mutase  38.15 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3811  hypothetical protein  43.12 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4901  phosphoglycerate mutase  44.37 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1421  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.47 
 
 		 194 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0249  phosphoglycerate mutase  36.88 
 
 		 187 aa  97.8  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1321  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.54 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1673  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.53 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2004  hypothetical protein  32.41 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2478  hypothetical protein  30.61 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1588  hypothetical protein  27.08 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0233366  hitchhiker  0.00932145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0931  hypothetical protein  42.47 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1672  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.73 
 
 		 220 aa  45.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.772188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.16 
 
 		 162 aa  42  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>