19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1421 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1421  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 194 aa  383  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3811  hypothetical protein  55.1 
 
 		 200 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4901  phosphoglycerate mutase  51.63 
 
 		 187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3911  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  46.86 
 
 		 187 aa  117  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3155  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  45.05 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.254789  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2185  phosphoglycerate mutase  41.4 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1928  fructose-2,6-bisphosphatase  44.1 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0905  Phosphoglycerate mutase  47.22 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1627  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.82 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1886  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.62 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.677546 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1321  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.89 
 
 		 183 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0249  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0931  hypothetical protein  35.58 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1588  hypothetical protein  27.44 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0233366  hitchhiker  0.00932145 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2004  hypothetical protein  32.58 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2478  hypothetical protein  34.38 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1673  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.99 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1672  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.82 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.772188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2834  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.49 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>