11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1880 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1880  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150791  normal  0.563397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3593  hypothetical protein  67.92 
 
 		 259 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42780  hypothetical protein  67.5 
 
 		 259 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2041  hypothetical protein  52.9 
 
 		 267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1851  hypothetical protein  51.87 
 
 		 267 aa  301  9e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1720  hypothetical protein  55 
 
 		 263 aa  298  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1436  hypothetical protein  54.37 
 
 		 262 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563659  normal  0.0403668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3882  hypothetical protein  54.41 
 
 		 260 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0219441  normal  0.242348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1828  hypothetical protein  54.02 
 
 		 260 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1406  hypothetical protein  55.87 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4676  hypothetical protein  26.32 
 
 		 234 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>