10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1828 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1828  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3882  hypothetical protein  98.08 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0219441  normal  0.242348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1406  hypothetical protein  93.08 
 
 		 260 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1436  hypothetical protein  77.48 
 
 		 262 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563659  normal  0.0403668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1851  hypothetical protein  58.87 
 
 		 267 aa  331  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482991  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2041  hypothetical protein  58.98 
 
 		 267 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1720  hypothetical protein  59 
 
 		 263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3593  hypothetical protein  57.03 
 
 		 259 aa  295  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42780  hypothetical protein  56.63 
 
 		 259 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1880  hypothetical protein  54.02 
 
 		 268 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150791  normal  0.563397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>